Notícies
21.06.2013
|
|
|
Els Centres Científics i Tecnològics de la Universitat de Barcelona (CCiTUB) i l’Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer (IMPPC) han concretat un
acord per a la cessió d’un seqüenciador de “nova generació” (NGS System) model Roche Junior. Aquest equip de seqüenciació massiva s’incorpora a la Tecnologia de Genòmica dels CCiTUB
i permetrà abordar projectes que requereixin un rendiment mig (30-40 Mb/ 70.000 reads) a un cost molt reduït en comparació als projectes de més gran escala que s’han dut a terme fins ara amb la plataforma
GS FLX+ de Roche (1Gb/ 1.000.000 reads). El seqüenciador “GS Junior System” està dissenyat a mida per tal d’abordar un ampli rang d’aplicacions que requereixin seqüències de fragments llargs d’alta qualitat i fiabilitat (Q20 read length of 400 bases - 99% accuracy at 400 bases). Entre les diferents aplicacions que es poden realitzar destaquen: - Seqüenciació d’amplicons - Detecció de patògens - Seqüenciació “de novo” de genomes bacterians complets - Metagenòmica - Seqüenciació de Full-length cDNA i acoblament “de novo” de transcriptomes - HLA typing amb GS GType HLA MR & HR Primer Sets - Seqüenciació de regions seleccionades i amplificades - Epigenòmica i anàlisi de metilació | |