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21.06.2013
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Los Centros Científicos y Tecnológicos de la Universidad de Barcelona y el Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer (IMPPC) han concretado un acuerdo
para la cesión de un secuenciador de “nueva generación” (NGS System) modelo Roche Junior. Este equipo de secuenciación masiva se incorpora a la Tecnología de Genómica de los CCiTUB
y permitirá abordar proyectos que requieran un rendimiento medio (30-40 Mb/ 70.000 reads) a un coste muy reducido en comparación a los proyectos de mayor escala que se han llevado a cabo hasta el momento con la
plataforma GS FLX+ de Roche (1Gb/ 1.000.000 reads). El secuenciador “GS Junior System” está diseñado a medida para abordar un amplio rango de aplicaciones que requieren secuencias de fragmentos largos de alta calidad y fiabilidad (Q20 read length of 400 bases - 99% accuracy at 400 bases). Entre las aplicaciones que se pueden realizar destacan: - Secuenciación de amplicones - Detección de patógenos - Secuenciación “de novo” de genomas bacterianos completos. - Metagenómica - Secuenciación de Full-length cDNA y ensamblaje “de novo” de transcriptomas. - HLA typing con GS GType HLA MR & HR Primer Sets - Secuenciación de regiones seleccionadas y amplificadas. - Epigenómica y análisis de metilación. | |