Centres Científics i Tecnològics UB

Seminari d'introducció a MNova (per al processament d'experiments de RMN)


Objectius Dirigit a Metodologia Data


 Objectius del curs

L'Objectiu és proporcionar les eines bàsiques per a l'utilització del programa MNova que permetin el correcte processat dels experiments de RMN que habitualment es programen als equips d'accés immediat.

Es tracta de donar un punt de partida que permeti a l'usuari experimentar posteriorment les nombroses funcions addicionals de que disposa el programa o solucionar els dubtes que hagin sorgit en una utilització prèvia.

 Dirigit a

Especialment als usuaris que hagin acabat de fer el curs d’iniciació però també a aquells usuaris que utilitzin de manera habitual els equips d'RMN en mode d'autoservei o aquells que en processin els resultats.

 Metodologia

El seminari s'ha estructurat en dos sessions de 1h+15 minuts en dies consecutius. Posteriorment i en funció de la demanda es poden organitzar una tercera sessió sobre aspectes més avançats presents en les últimes versions del programa

 Data

9 i 10 d'Octubre de 2012.


A. Introducció a la Utilització del MNova (Espectres d'1D)

Descripció del MNOVA

Importar espectres, formats admesos
- Apertura múltiple d'espectres

Processat d'espectres 1D i transformada de Fourier
- Funcions de processat: què fan, per a què serveixen i quina és la seva aplicació en un experiment d'1D, ajustament interactiu.
- Omplert de zeros
- Protó: millora de la resolució.
- Carboni tretze: reducció del nivell de soroll.

Ajustaments bàsics de l'espectre d'1D
- Ajustament de la intensitat i correcció de la fase
- Referenciar l'espectre
- Definir les zones d'integració i llistat de senyals.
- Detecció i marcatge de les senyals de dissolvent i impureses.
- Correcció de la línea de base de l'espectre.
- Ampliacions, insets i Cutting d'espectres.
- Supressió de senyals de dissolvent.
- Copiar i enganxar zones d'integracions i/o propietats gràfiques dels espectres

Generació de taules, Reports

- Llistats de paràmetres
- Llistats de freqüències i integracions, incorporació a documents office
- Incorporació de gràfics i objectes.

B. Processat d'experiments de 2D

Funcions de processat als experiments bidimensionals

- Funcions de processat
- Predicció lineal
- Diferències de les condicions de processat en funció del tipus d'experiment

Ajustaments bàsics dels espectres de 2D

- Ajustament de la fase en els espectres de 2D sensible a la fase
- Referència en els experiments 2D

Mapes de contorn.

- Ajustament dels nivells i els diferents colors de les línees de contorn
- Incorporació de traces i espectres reals en els eixos del mapa de contorn.

Exemples de processat

- gCosy, gHSQC,
- experiment NOESY o ROESY.
- Eines que poden facilitar l'extracció de resultats en el NOESY
- Correcció de la línea de base
- Supressió de soroll en t1

C. Avançat

Treball amb múltiples experiments d'1D Comparació d'espectres

- Eines disponibles
- Suma i resta d'espectres.

Combinació de diferents experiments 1D i 2D

- Utilització de cursors múltiples
- Superposició de mapes de contorn. Comparació NOESY vs COSY

Altres Utilitats del Mnova

- Utilització de scripts per a facilitar operacions repetitives.
- Facilitats per a l'assignació d'espectres, relació entre un gràfic de la molècula i les diferents senyals.
- Plugins addicionals. Predicció d'espectres, Assignació automàtica, un primer pas

Inscripció:

Enviar un email a informn@ccit.ub.edu.

Data límit inscripció: divendres 5 d’octubre de 2012 o fins exhaurir les places disponibles
Important: Si la demanda supera les 20 sol.licituds s’establirà un segon grup en funció de la mateixa i de les disponibilitats de realització.

Per a més informació:

Tecnologia de Ressonància Magnètica Nuclear (RMN). CCiTUB.

Recomanacions:

Per a facilitar l'aprofitament i l'intervenció de tots els assistents, es recomana assistir amb un ordinador portàtil. D'aquesta manera, es podran posar en pràctica de forma immediata totes les indicacions. Al portàtil es pot instal·lar una versió demo del MNova (validesa de 45 dies) que pot descarregar-se de la pàgina web de MESTRELAB. Al executar el fitxer el programa s'instal·la i seguint les instruccions és possible obtenir una llicència demo amb rapidesa.

Els usuaris que ho desitgin podran disposar d'una còpia dels Fids que s'utilitzaran durant el seminari.

Organitza:

Centres Científics i Tecnològics
Universitat de Barcelona
Director: Dr. Jose Ramón Seoane Trigo

Coordinador:
Dr. Miguel Feliz
Tecnologia de Ressonància Magnètica Nuclear (RMN) CCiTUB.








Contingut

Document



[Altres Activitats]