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El objetivo es proporcionar las herramientas básicas para la utilización del programa MNova que permitan el correcto procesado de los experimentos de RMN que habitualmente se programan en los equipos de acceso inmediato.
Se trata de dar un punto de partida que permita al usuario experimentar posteriormente las numerosas funciones adicionales de que dispone el programa o solucionar las dudas que hayan surgido en una utilización previa.
Especialmente a los usuarios que hayan acabado de realizar el curso de iniciación pero también a aquellos usuarios que utilicen de manera habitual los equipos de RMN en modo de autoservicio o aquellos que procesen los resultados.
 Metodología
El seminario se ha estructurado en dos sesiones de 1h+15 minutos en días consecutivos. Posteriormente y en función de la demanda se puede organizar una tercera sesión sobre aspectos más avanzados presentes en las últimas versiones del programa
9 y 10 de Octubre de 2012.
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A. Introducción a la Utilización del MNova (Espectros de 1D)
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Descripción del MNOVA
Importar espectros, formatos admitidos
- Apertura múltiple de espectros
Procesado de espectros 1D y transformada de Fourier
- Funciones de procesado: qué hacen, para qué sirven y cuál es su aplicación en un experimento de 1D, ajuste interactivo.
- Llenado de ceros
- Protón: mejora de la resolución.
- Carbono trece: reducción del nivel de ruido.
Ajustes básicos del espectro de 1D
- Ajuste de la intensidad y corrección de la fase
- Referenciar el espectro
- Definir las zonas de integración y listado de señales.
- Detección y marcaje de las señales de disolvente e impurezas.
- Corrección de la línea de base del espectro.
- Ampliaciones, insets y Cutting de espectros.
- Supresión de señales de disolvente.
- Copiar y pegar zonas de integraciones y/o propiedades gráficas de los espectros
Generación de tablas, Reports
- Listados de parámetros
- Listados de frecuencias e integraciones, incorporación a documentos office
- Incorporación de gráficos y objetos.
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B. Procesado de experimentos de 2D
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Funciones de procesado en los experimentos bidimensionales
- Funciones de procesado
- Predicción lineal
- Diferencias de las condiciones de procesado en función del tipo de experimento
Ajustes básicos de los espectros de 2D
- Ajuste de la fase en los espectros de 2D sensible a la fase
- Referencia en los experimentos 2D
Mapas de contorno.
- Ajuste de los niveles y los distintos colores de las líneas de contorno
- Incorporación de trazas y espectros reales en los ejes del mapa de contorno.
Ejemplos de procesado
- gCosy, gHSQC,
- experimento NOESY o ROESY.
- Herramientas que pueden facilitar la extracción de resultados en el NOESY
- Corrección de la línea de base
- Supresión de ruido en t1
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C. Avanzado
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Trabajo con múltiples experimentos de 1D Comparación de espectros
- Herramientas disponibles
- Suma y resta de espectros.
Combinación de varios experimentos 1D y 2D
- Utilización de cursores múltiples
- Superposición de mapas de contorno. Comparación NOESY vs COSY
Otras Utilidades del Mnova
- Utilización de scripts para facilitar operaciones repetitivas.
- Facilidades para la asignación de espectros relación entre un grafico de la molécula y las diferentes señales.
- Plugins adicionales. Predicción de espectros, Asignación automática, un primer paso
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Inscripción:
Enviar un email a informn@ccit.ub.edu.
Fecha límite inscripción: viernes 5 de octubre de 2012 o hasta agotar las plazas disponibles
Importante: Si la demanda supera las 20 solicitudes se establecerá un segundo grupo en función de la misma y de las disponibilidades de realización.
Para más información:
Tecnología de Ressonància Magnética Nuclear (RMN). CCiTUB.
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Recomendaciones:
Para facilitar el aprovechamiento y la intervención de todos los asistentes, se recomienda asistir con un ordenador portátil. De este modo, se podrá poner en práctica de modo inmediato todas las indicaciones. En el portátil se puede instalar una versión demo del MNova (validez de 45 días) que puede descargarse de la página web de MESTRELAB. Al ejecutar el fichero el programa se instala y siguiendo las instrucciones es posible obtener una licencia demo con rapidez.
Los usuarios que lo deseen podrán disponer de una copia de los Fids que se utilizarán durante el seminario.
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Organiza: |
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Centres Científics i Tecnològics
Universitat de Barcelona
Director: Dr. Jose Ramón Seoane Trigo
Coordinador:
Dr. Miguel Feliz
Tecnología de Ressonància Magnètica Nuclear (RMN) CCiTUB.
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