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El curso de Microscopía Optimizada por Ordenador esta dirigido a investigadores (personal de laboratorios de microscopía, pre i post-docs, PIs, etc.) que trabajan con imágenes digitales obtenidas por diversas técnicas de microscopía óptica. El curso proporciona una serie de sesiones prácticas y teóricas orientadas a mostrar el flujo de procesado de imágenes necesario para extraer información cuantitativa de diferentes técnicas básicas y avanzadas de microscopía. Se comenzará por una visión general de las bases del procesado de imágenes y se irá aprofundiendo hasta a focalizar en aplicaciones específicas.
Se utilizará el software libre ImageJ / Fiji como herramienta principal del curso. Para algunas aplicaciones específicas, también se utilizarán otros softwares gratuitos y comerciales, y así proporcionar un abanico más amplio de soluciones a problemas específicos de procesado de imágenes.
General Subjects:
Parameters to optimize image acquisition
Introductions to some useful Fiji tools
Image restoration: filters
Image restoration: deconvolution
Segmentation and binnary operations
Automation of the process: Introduction to the macro language
Specific applications:
Colocalization of molecules
Cell tracking
3D reconstruction
FRET acceptor photobleaching and FRAP analysis
Macro programming of some specific applications already seen
High content screening
Machine learning
Inglés.
26 - 30 de Junio, 2017
Preu: 320€.
El precio incluye: registro, un PC para cada alumno, el material del curso, los cofee breaks y comidas, y el social dinner.
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Facultad de Biología
Universitat de Barcelona
Nuevo Edificio (Edificio Prevosti) Sala 22, Piso -1.
Av. Diagonal 643.
08028 Barcelona
España
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| Hora | Formador | Tema |
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| 10:30 - 11:00h | Manel Bosch | Welcome |
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| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Elena Rebollo | Optimization of image acquisition |
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| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Elena Rebollo | ImageJ / Fiji introduction and tools |
| 17:00 - 17:30h | | Coffee Break |
| 17:30 - 19:30h | Anna Bosch | Introduction to macro language |
| Hora | Formador | Tema |
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| 09:00 - 11:00h | Mª Teresa Castells | Image restoration: filters |
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| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Sebastien Tosi | Image restoration: Deconvolution |
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| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Manel Bosch | Image segmentation I:
Segmentation methods |
| 17:00 - 17:30h | | Coffee Break |
| 17:30 - 19:30h | Anna Bosch | Introduction to macro language |
| 21:30 | | Social Dinner |
| Hora | Formador | Tema |
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| 09:00 - 11:00h | Manel Bosch | Image segmentation II:
Binary operations |
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| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Maria Calvo | Colocalization |
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| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Elena Kardash | FRET analysis |
| 17:00 - 17:30h | | Coffee Break |
| 17:30 - 19:30h | Manel Bosch | Macro programming |
| Hora | Formador | Tema |
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| 09:00 - 11:00h | Elena Rebollo | Cell
tracking |
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| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Chong Zhang | 3D Reconstruction |
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| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Diego Megías | FRAP analysis |
| 17:00 - 17:30h | | Coffee break |
| 17:30 - 19:30h | Manel Bosch | Macro programming |
| Hora | Formador | Tema |
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| 09:00 - 11:00h | Diego Megías-Paco Porto | High content screening |
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| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Sebastien Tosi | Machine learning |
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| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Manel Bosch | Macro programming |
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 Anna Bosch. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB
Manel Bosch. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB
Maria Calvo. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB
Maria Teresa Castells. Servicio de Apoyo a la Investigación. Universidad de Murcia
Elena Kardash. Biochemistry department. University of Geneva
Diego Megías. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas. CNIO
Paco Porto. Leica Microsystems
Elena Rebollo. Institut de Biologia Molecular de Barcelona. IBMB-CSIC
Sebastien Tosi. Institut de Recerca Biomèdica de Barcelona. IRBB
Chong Zhang. SIMBioSys. Universitat Pompeu Fabra.
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ATENCIÓN: Registro abierto hasta 14 Mayo, 2017. Recuerde que esto es una preinscripción. Recibirá un correo durante la semana del 22 de Mayo indicando si su inscripción finalmente ha sido aceptada.
Precio: 320€
(*) campos obligatorios
NOTAS: El número de plazas es limitado. El curso depende del número de estudiantes inscritos. Un estudiante no se considerará inscrito hasta que el pago esté realizado. En caso que el estudiante cancele la inscripción, ha de avisar 15 días antes que el curso empiece.Recibirá un correo durante la semana del 22 de Mayo indicando si su inscripción finalmente ha sido aceptada.
Para más información contactar con:
admincursos@ccit.ub.edu.
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