Centres Científics i Tecnològics UB

Computer Optimized Microscopy Course
 Setena edició


Objectius

Metodologia

Idioma

Dates

Preu

Lloc


Objectius

El curs de Microscòpia Optimitzada per Ordinador està adreçat a investigadors (personal de laboratoris de microscòpia, pre i post-docs, PIs, etc.) que treballen amb imatges digitals obtingudes per diverses tècniques de microscòpia òptica. El curs proporciona una sèrie de sessions pràctiques i teòriques orientades a mostrar el flux de processat d'imatges necessari per a extreure informació quantitativa de diferents tècniques bàsiques i avançades de microscòpia. Es començarà per una visió general de les bases del processat d'imatges i s'anirà aprofundint fins a focalitzar en aplicacions específiques.

Metodologia

S'utilitzarà el software lliure ImageJ / Fiji com a eina principal del curs. Per a algunes aplicacions específiques, també s'utilitzaran altres softwares gratuïts i comercials, i així proporcionar un ventall més ampli de solucions a problemes específics de processat d'imatges.

Principals temes:
      Paràmetres per a optimitzar l'adquisició d'imatges
      Propietats de les imatges digitals
      Restauració d'imatges: filtres
      Restauració d'imatges: deconvolució
      Segmentació
      Automatització del procés: programació de macros

Aplicacions específiques:
      Colocalització de molècules
      Seguiment cel·lular
      Anàlisi FRET i FRAP
      High content screening
      Reconstrucció 3D
      Aprenentatge automàtic

Idioma del curs:

Anglès.

Dates

30 Juny - 3 de Juliol, 2015

Preu

Preu: 250€.
El preu inclou: registre, un PC per cada alumne, el material del curs, els cofee breaks i dinars, i el social dinner.

Localització

Facultat de Biologia
Universitat de Barcelona
Nou Edifici (Edifici Prevosti) Sala 22, Pis -1.
Av. Diagonal 643.
08028 Barcelona
Espanya


mapa Campus Diagonal



Hora
Formador
Tema

09:00 - 09:30h
Manel Bosch
Welcome, Overview
09:30 - 11:00h
Elena Rebollo
Optimization of image acquisition
11:00 - 11:30hCoffee Break
11:30 - 13:30h
Elena Rebollo
ImageJ / Fiji introduction and tools
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Mª Teresa Castells
Image restoration: Filters
17:00 - 17:30hCoffee Break
17:30 - 19:30h
Manel Bosch
Introduction to macro language
21:30hSocial Dinner


Hora
Formador
Tema

09:00 - 11:00h
Carlos Sánchez
Image restoration: Deconvolution
11:00 - 11:30hCoffee Break
11:30 - 13:30h
Manel Bosch
Image segmentation
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Elena Rebollo
3D Reconstruction
17:00 - 17:30hCoffee Break
17:30 - 19:30h
Manel Bosch
Introduction to macro language


Hora
Formador
Tema

09:00 - 11:00h
Elena Rebollo
Cell tracking
11:00 - 11:30hCoffee Break
11:30 - 13:30h
Maria Calvo
Colocalization
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Elena Kardash
FRET analysis
17:00 - 17:30hCoffee Break
17:30 - 19:30h
Manel Bosch
Macro programming


Hora
Formador
Tema

09:00 - 11:00h
Diego Megías
FRAP analysis
11:00 - 11:30hCoffee Break
11:30 - 13:30h
Diego Megías-Paco Porto
High content screening
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Sebastien Tosi
Machine learning
17:00 - 17:30hCoffee Break
17:30 - 19:30h
Manel Bosch
Macro programming

Organització

Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona.
Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB) - CSIC.

Coordinadors científics

Manel Bosch.
Advanced Optical Microscopy Technology. Centres Científics i Tecnològics (CCiTUB)

Elena Rebollo.
Advanced Fluorescent Microscopy Unit. Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB)

                  


 Manel Bosch. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB

 Maria Calvo. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB

 Maria Teresa Castells. Servicio de Apoyo a la Investigación. Universidad de Murcia

 Elena Kardash. Biochemistry department. University of Geneva

 Diego Megías. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas. CNIO

 Paco Porto. Leica Microsystems

 Elena Rebollo. Institut de Biologia Molecular de Barcelona. IBMB-CSIC

 Carlos Sánchez. Servicio de Microscopía Optica y Confocal. Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM)

 Sebastien Tosi. Institut de Recerca Biomèdica de Barcelona. IRBB


ATENCIÓ: Registre obert fins 30 Abril, 2015.


Preu: 250€

Formulari de registre:
Inscripció tancada.


(*) camps obligatoris

NOTES: El nombre de seients és limitat. El curs depen del nombre d'estudiants inscrits. Un estudiant no es considerarà inscrit fins a que el pagament estigui realitzat. En cas que l'estudiant cancel·li la inscripció, ha d'avisar 15 dies abans que el curs comenci.

Per a més informació contactar amb:
admincursos@ccit.ub.edu.


Sponsors



                                    

Content

Documents

Informació resumida +info
Programa +info




[Altres Activitats]




Highslide JS