| Objectius |
Data |
Lloc |
Dades Generals |
|
El processat i anàlisi d’imatges digitals de microscòpia òptica permet extreure la màxima informació de las tècniques aplicades.
El programa Image J (Wayne Rasband, NIH, USA), obert i d’accés lliure, s’ha convertit en una eina fonamental per al processat i anàlisi d’imatges científiques digitals.
L’objectiu d’aquest curs és proporcionar als participants els coneixements i estratègies per a processar i analitzar les imatges de microscòpia òptica utilitzant el programa d’accés lliure ImageJ.
El curs consisteix en classes teòriques i pràctiques amb ordinador.
Durant el curs es mostraran els procediments estàndard de treball amb aplicacions reals de microscòpia òptica avançada. Es treballarà la combinació de les diferents tècniques de processat d’imatges per a poder identificar, aïllar i analitzar els elements d’interès específics de cada imatge.
El curs està dirigit a investigadors i professionals que requereixen el processat i anàlisi d’imatges, familiaritzats amb tècniques de microscòpia òptica o que hagin de treballar amb elles en el futur.
 Data
10ª Edició
30 de Maig 2012: 10-18h
31 de Maig 2012: 9-14h
11ª Edició
5 de Juny 2012: 10-18h
6 de Juny 2012: 9-14h
Aula d'Informàtica 2, 4ª planta.
Facultat de Medicina.
C/ Casanova, 143
08036 Barcelona
|
|
|
Num participants: 20
Curs pràctic: 1 ordinador per participant
Inscripció: 120€ (el preu inclou documentació, pausa cafè i dinar)
Preinscripció electrònica a través de la pàgina web
Per a informació i consultes: confomed@ccit.ub.edu
|
Introducció a ImageJ:
Recursos. Instal·lació. Funcionament. Plugins. Macros.
Introducció a la Imatge Digital:
Ressolució. Profunditat. Format. Dimensions.
Processat d’Imatges i pel·lícules (xyt, xyzt):
Calibració. Separació/Fusió de Canals. Taules de color (LUT). Ajust de brillantor/contrast. Filtres. Stacks. Projeccions. Seccions ortogonals. Reconstrucció tridimensional. Edició (text, barra escala, àrees, fletxes, temps…)
Anàlisi d’Imatges:
- Quantificació:
Segmentació basada en llindar (threshold). Histograma. Morfometria. Perfils d’intensitat. Operacions amb imatges. Quantificació de sèries d’imatges (xyz, xyt)
- Anàlisi de partícules:
Comptador de partícules. Find Maxima. Mobilitat de partícules al llarg del temps (particle tracking). Kimogrames.
- Col·localització:
Introducció a l’anàlisi de la col·localització. Mètodes qualitatius i quantitatius.
Estratègies avançades d’anàlisi.
Introducció a Macros.
Solució de casos pràctics proposats pels participants.
|
IMPORTANT
Preinscripció tancada.
|
|
|
Contingut |
Document |
|
| Informació resumida |
+info  |
|
| Flyer promocional |
+info |
|
|
