Objectius |
Metodologia |
Idioma |
Dates |
Preu |
Lloc |
|
El curs de Microscòpia Optimitzada per Ordinador està adreçat a investigadors (personal de laboratoris de microscòpia, pre i post-docs, PIs, etc.) que treballen amb imatges digitals obtingudes per diverses tècniques de microscòpia òptica. El curs proporciona una sèrie de sessions pràctiques i teòriques orientades a mostrar el flux de processat d'imatges necessari per a extreure informació quantitativa de diferents tècniques bàsiques i avançades de microscòpia. Es començarà per una visió general de les bases del processat d'imatges i s'anirà aprofundint fins a focalitzar en aplicacions específiques.
S'utilitzarà el software lliure ImageJ / Fiji com a eina principal del curs. Per a algunes aplicacions específiques, també s'utilitzaran altres softwares gratuïts i comercials, i així proporcionar un ventall més ampli de solucions a problemes específics de processat d'imatges.
General Subjects:
Parameters to optimize image acquisition
Introductions to some useful Fiji tools
Image restoration: filters
Image restoration: deconvolution
Segmentation and binnary operations
Automation of the process: Introduction to the macro language
Specific applications:
Colocalization of molecules
Cell tracking
3D reconstruction
FRET acceptor photobleaching and FRAP analysis
Macro programming of some specific applications already seen
High content screening
Machine learning
Anglès.
27-Juny al 1-Juliol, 2016
Preu: 300€.
El preu inclou: registre, un PC per cada alumne, el material del curs, els cofee breaks i dinars, i el social dinner.
|
Facultat de Biologia
Universitat de Barcelona
Nou Edifici (Edifici Prevosti) Sala 22, Pis -1.
Av. Diagonal 643.
08028 Barcelona
Espanya
|
|
| Hora | Formador | Tema |
| |
| 10:30 - 11:00h | Manel Bosch | Welcome |
| ||
| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Elena Rebollo | Optimization of image acquisition |
|
| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Elena Rebollo | ImageJ / Fiji introduction and tools |
| 17:00 - 17:30h | | Coffee Break |
| 17:30 - 19:30h | Anna Bosch | Introduction to macro language |
| Hora | Formador | Tema |
| |
| 09:00 - 11:00h | Mª Teresa Castells | Image restoration: filters |
| ||
| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Sebastien Tosi | Image restoration: Deconvolution |
|
| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Manel Bosch | Image segmentation I:
Segmentation methods |
| 17:00 - 17:30h | | Coffee Break |
| 17:30 - 19:30h | Anna Bosch | Introduction to macro language |
| 21:30 | | Social Dinner |
| Hora | Formador | Tema |
| |
| 09:00 - 11:00h | Manel Bosch | Image segmentation II:
Binary operations |
| ||
| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Maria Calvo | Colocalization |
|
| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Elena Kardash | FRET analysis |
| 17:00 - 17:30h | | Coffee Break |
| 17:30 - 19:30h | Manel Bosch | Macro programming |
| Hora | Formador | Tema |
| |
| 09:00 - 11:00h | Elena Rebollo | Cell
tracking |
| ||
| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Chong Zhang | 3D Reconstruction |
| ||
| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 15:00 - 17:00h | Diego Megías | FRAP analysis |
| 17:00 - 17:30h | | Coffee break |
| 17:30 - 19:30h | Manel Bosch | Macro programming |
| Hora | Formador | Tema |
| |
| 09:00 - 11:00h | Diego Megías-Paco Porto | High content screening |
| ||
| 11:00 - 11:30h | | Coffee break |
| 11:30 - 13:30h | Sebastien Tosi | Machine learning |
|
| 13:30 - 15:00h | | Lunch |
| 17:30 - 19:30h | Manel Bosch | Macro programming |
|
 Anna Bosch. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB
Manel Bosch. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB
Maria Calvo. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB
Maria Teresa Castells. Servicio de Apoyo a la Investigación. Universidad de Murcia
Elena Kardash. Biochemistry department. University of Geneva
Diego Megías. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas. CNIO
Paco Porto. Leica Microsystems
Elena Rebollo. Institut de Biologia Molecular de Barcelona. IBMB-CSIC
Sebastien Tosi. Institut de Recerca Biomèdica de Barcelona. IRBB
Chong Zhang. SIMBioSys. Universitat Pompeu Fabra.
|
ATENCIÓ: Registre obert fins 15 Maig, 2016. Recordeu que això és una preinscripció. Rebrà un correu durant la setmana del 9 de Maig indicant si la seva inscripció finalment ha estat acceptada.
Preu: 300€
(*) camps obligatoris
NOTES: El nombre de seients és limitat. El curs depen del nombre d'estudiants inscrits. Un estudiant no es considerarà inscrit fins a que el pagament estigui realitzat. En cas que l'estudiant cancel·li la inscripció, ha d'avisar 15 dies abans que el curs comenci.Rebrà un correu durant la setmana del 9 de Maig indicant si la seva inscripció finalment ha estat acceptada.
Per a més informació contactar amb:
admincursos@ccit.ub.edu.
|
Content |
Documents |
|
| Informació resumida |
+info  |
|
|
|
