Centres Científics i Tecnològics UB

Computer Optimized Microscopy Course
 Décima Edición


Objetivos

Metodología

Idioma

Fechas

Precio

Lugar


Objetivos

El curso de Microscopía Optimizada por Ordenador esta dirigido a investigadores (personal de laboratorios de microscopía, pre i post-docs, PIs, etc.) que trabajan con imágenes digitales obtenidas por diversas técnicas de microscopía óptica. El curso proporciona una serie de sesiones prácticas y teóricas orientadas a mostrar el flujo de procesado de imágenes necesario para extraer información cuantitativa de diferentes técnicas básicas y avanzadas de microscopía. Se comenzará por una visión general de las bases del procesado de imágenes y se irá aprofundiendo hasta a focalizar en aplicaciones específicas.

Metodología

Se utilizará el software libre ImageJ / Fiji como herramienta principal del curso. Para algunas aplicaciones específicas, también se utilizarán otros softwares gratuitos y comerciales, y así proporcionar un abanico más amplio de soluciones a problemas específicos de procesado de imágenes.

General Subjects:
      Parameters to optimize image acquisition
      Introductions to some useful Fiji tools
      Image restoration: filters
      Image restoration: deconvolution
      Segmentation and binnary operations
      Automation of the process: Introduction to the macro language

Specific applications:
      Colocalization of molecules
      Cell tracking
      3D reconstruction
      FRET acceptor photobleaching and FRAP analysis
      Macro programming of some specific applications already seen
      High content screening
      Machine learning

Idioma del curso:

Inglés.

Fechas

25 - 29 de Junio, 2018

Precio

Preu: 320€.
El precio incluye: registro, un PC para cada alumno, el material del curso, los cofee breaks y comidas, y el social dinner.

Localización

Facultad de Biología
Universitat de Barcelona
Nuevo Edificio (Edificio Prevosti) Sala 22, Piso -1.
Av. Diagonal 643.
08028 Barcelona
España


mapa Campus Diagonal



Hora
Formador
Tema

09:00 - 9:30h
Manel Bosch
Welcome
09:30 - 11:00h
Elena Rebollo
Optimization of image acquisition
11:00 - 11:30hCoffee break
11:30 - 13:30h
Elena Rebollo
ImageJ / Fiji introduction and tools
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Mª Teresa Castells
Image restoration: Filters
17:00 - 17:30hCoffee Break
17:30 - 19:30h
Anna Bosch
Introduction to macro language


Hora
Formador
Tema

09:00 - 11:00h
Sebastien Tosi
Image restoration: Deconvolution
11:00 - 11:30hCoffee break
11:30 - 13:30h
Manel Bosch
Image segmentation I: Segmentation methods
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Anna Bosch
Introduction to macro language
17:00 - 17:30hCoffee Break
19:00 - 21:30hGuided tour of Sta. Maria del Mar
21:30Social Dinner


Hora
Formador
Tema

09:00 - 11:00h
Manel Bosch
Image segmentation II: Binary operations
11:00 - 11:30hCoffee break
11:30 - 13:30h
Maria Calvo
Colocalization
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Elena Kardash
FRET analysis
17:00 - 17:30hCoffee Break
17:30 - 19:30h
Manel Bosch
Macro programming


Hora
Formador
Tema

09:00 - 11:00h
Elena Rebollo
Cell tracking
11:00 - 11:30hCoffee break
11:30 - 13:30h
Chong Zhang
3D Reconstruction                  
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Diego Megías
FRAP analysis
17:00 - 17:30hCoffee break
17:30 - 19:30h
Manel Bosch
Macro programming


Hora
Formador
Tema

09:00 - 11:00h
Diego Megías-Paco Porto
High content screening                   
11:00 - 11:30hCoffee break
11:30 - 13:30h
Sebastien Tosi
Machine learning
13:30 - 15:00hLunch
15:00 - 17:00h
Manel Bosch
Macro programming

Organización

Centros Científicos y Tecnológicos. Universitat de Barcelona.
Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB) - CSIC.

Coordinadores científicos

Manel Bosch.
Tecnología de Microscopía Óptica Avanzada. Centros Científicos y Tecnológicos (CCiTUB)

Elena Rebollo.
Advanced Fluorescent Microscopy Unit. Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB)

                  


 Anna Bosch. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB

 Manel Bosch. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB

 Maria Calvo. Centres Científics i Tecnològics. Universitat de Barcelona. CCiTUB

 Maria Teresa Castells. Servicio de Apoyo a la Investigación. Universidad de Murcia

 Elena Kardash. Biochemistry department. University of Geneva

 Diego Megías. Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas. CNIO

 Paco Porto. Leica Microsystems

 Elena Rebollo. Institut de Biologia Molecular de Barcelona. IBMB-CSIC

 Sebastien Tosi. Institut de Recerca Biomèdica de Barcelona. IRBB

 Chong Zhang. SIMBioSys. Universitat Pompeu Fabra.


ATENCIÓN: Registro abierto hasta 27 Mayo, 2018. Recuerde que esto es una preinscripción. Recibirá un correo durante la semana del 30 de Mayo indicando si su inscripción finalmente ha sido aceptada.


Precio: 320€

Formulario de registro:
Inscripción cerrada.


(*) campos obligatorios

NOTAS: El número de plazas es limitado. El curso depende del número de estudiantes inscritos. Un estudiante no se considerará inscrito hasta que el pago esté realizado. En caso que el estudiante cancele la inscripción, ha de avisar 15 días antes que el curso empiece.Recibirá un correo durante la semana del 30 de Mayo indicando si su inscripción finalmente ha sido aceptada.

Para más información contactar con:
admincursos@ccit.ub.edu.


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